L'Azienda USL di Ferrara è stata istituita il 1° luglio del 1994, quando sono stata unificate in un'unica azienda sanitaria territoriale le cinque USL nelle quali era articolata la sanità pubblica ferrarese.
L'ambito territoriale dell'Azienda USL coincide con la Provincia di Ferrara. Copre un'area di 2.632 kmq, con una densità di popolazione di circa 132 abitanti per kmq e con le problematiche tipiche della distribuzione della popolazione tra insediamenti urbani e rurali. E' suddivisa in tre Distretti territoriali, nei quali sono distribuiti le strutture che forniscono assistenza sanitaria.
Tutti gli ospedali, ambulatori e poliambulatori sono coordinati dal Presidio Unico Ospedaliero.